拉康大殿，总面积6769平方米，东西长度79.4米，南北宽度84.8米，在藏语中叫“拉康钦莫”，有大神殿之意，并且是萨迦寺的主体建筑。拉康大殿因其面积之大，一次可容纳万名僧人念经，大殿里共有40根柱子，最粗的一根直径1.5米，当地人趣称它为“加纳色钦嘎瓦”，也就是元朝送的柱子，很有趣。另外还有四根柱子也比较粗，3个人才抱得住，也是很壮观。听说，民间有这样一个故事叫“皇帝赐柱”，皇帝听说八思巴兴修南寺，就赐予一根直径4尺的柱子，因为大不好运，最后竟奇迹般自己出现在寺北的仲曲河上，很神奇呀。其他3根分别叫公老虎送的柱子”、“野牦牛送的柱子”、“海神送的柱子",看他们的名字就知道各自有有趣的故事。
拉康大殿的二楼坛城殿里保存着最完好的元代壁画——坛城壁画，另外，拉康大殿里共有63座坛城，最大一个直径差不多3米。大殿里还供奉着释迦三世佛像和萨迦五祖,历代萨迦法王的灵塔保存在灵塔殿内，菩提塔式样的有5座，高为8米差不多。萨迦教派在当地很有名，并且有很多关于它的故事，连妇孺都知道。拉康大殿有很多有深意的建筑，我们也可以学到很多。

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